死亡证明丢失后仅剩下一个小存根，派出所说没办法在网上自动驻销， 医院又不能补发死亡证明， 该怎么办？那个部门可以解决问题？
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你可以到医院、民政部门或公安机关开具或补开具死亡证明，然后到死者生前户籍所在地的派出办理注销户口手续。
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死亡证明存根有一联是给公安机关的，请看是否是你手上的那个，如果丢失，社区出具证明，带上死者身份证和户口本派出所应当予以注销。
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到社区（村委）开证明再去派出所注销。如果以各种不实际理由拒绝注销，就不要注销，到有什么好处时仍按照户口人数得一份那不是更好？
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到便民中心去
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医院应该补发死亡证明
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应该可以补开的。
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民政部门，你可以去那里进行协商一下，看如何解决。