绝大多数酶是蛋白质，蛋白质酶也是蛋白质，为什么蛋白酶不水解自己呢？若水解了自己，它还能够继续起作用吗？

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蛋白质酶一般都有特异的氨基酸序列识别位点，特异的几何空间结构，再加上甲基化等化学修饰，保证它不会被自己酶解。有些酶最初是以酶原的形式存在的，经过其他酶的分解，变成有活力的酶，才开始发挥作用（就是激活过程）。生物体有他自身的一套完备的调控机制。

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蛋白质酶是有生物活性的，一旦它失去了活性，他会被其他的蛋白酶水解，其本身的酶催化作用也就不能发生了。蛋白质有其本身的结构特点，结构决定性质，就像蛇本身释放毒素，但本身不会被毒所伤，保护蛋白质酶的就是它的空间结构和上面特有的化学物质。