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影响因素包括：1、流动性，交投活跃的债券到期收益率较低，深圳和上海同品种的国债收益不同；2、票面利率，票面利率越高，收益率变化引起债券价格变化的百分比越小，另外票面利率越高，投机性越强；3、风险溢价，风险越大，收益越高，不同的企业债价格不同；4、税收待遇，企业债和国债税收不同；5、早赎条款影响；6、机构作盘。
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总之，是市场行为，很难确定。楼上说的都很对。
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1/流动性：同样的品种，深市沪市价格会有偏差。跨银行间交易所与非跨市场国债会有区别2/债息高低：存续期相当的情况下，会有偏差。3/固息和浮息会有偏差4/机构被套、被迫锁仓5/券商或某些机构被迫套现还钱