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柜台记账式国债交易开通后，投资人即使在发行期间没有买到国债，也可以在发行结束后，通过商业银行柜台随时买卖国债。商业银行可以根据柜台市场国债的需求情况，及时通过银行间债券市场买进国债，再通过柜台卖给投资人，从而可以最大限度地满足广大投资人的国债投资需求。而凭证式国债只有在规定的发行期内方可买到。 记账式国债发行结束后，可以在商业银行柜台进行流通转让，流通转让价格依据当时经济金融状况，适应市场变化；凭证式国债发行结束后不可以流通转让，但可以按规定到商业银行提前兑取。
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交易所债券需在证券营业部开立证券账户；柜台债券通过银行办理，在银行开立账户。 交易费用：交易所买卖债券时需按交易量缴纳交易费用；买卖柜台债券不需交纳交易费用。 买卖成交：交易所债券的成交方式为撮合式，买卖价格和数量一致时成交，若不一致，则可能不成交或部分成交；银行柜台债券的成交方式为做市商式，当场成交。
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场所：交易所债券需在证券营业部开立证券账户；柜台债券通过银行办理，在银行开立账户。 交易费用：交易所买卖债券时需按交易量缴纳交易费用；买卖柜台债券不需交纳交易费用。 买卖成交：交易所债券的成交方式为撮合式，买卖价格和数量一致时成交，若不一致，则可能不成交或部分成交；银行柜台债券的成交方式为做市商式，当场成交。
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柜台交易的记帐式国债与交易所的国债有何区别？ 场所：交易所债券需在证券营业部开立证券账户；柜台债券通过银行办理，在银行开立账户。 交易费用：交易所买卖债券时需按交易量缴纳交易费用；买卖柜台债券不需交纳交易费用。 买卖成交：交易所债券的成交方式为撮合式，买卖价格和数量一致时成交，若不一致，则可能不成交或部分成交；银行柜台债券的成交方式为做市商式，当场成交。