中央台在下午的直播中播放的神六入轨时间显示的是大约13:55，当时的主持人李小萌也对此产生了疑问，并多次询问当时驻北京飞控中心的另一位主持人张羽，是否这个时间就是准确的入轨时间，可是并未得到他的答复。后来李小萌可能是得到导播的提示，认为是由于时差的原因，显示在屏幕上的时间就相当于北京时间15:55。可是这一说法是根本站不住脚的，因为当时飞船入轨所处的可监控区域为远望2号所在的区域，而这一区域应比北京时间要早。而 如果说这 个时间是飞船上的时间，那也不成立，因为我们之前看到的画面都是在同样位置显示的时间，并未出现类似的问题。而且在稍后看到的宇航员穿舱时间17:28也和北京时间是一致的。 这样就产生了疑问，这个13:55的时间到底是怎么回事，我们看到的画面是真实的吗？（这次神六的转播直播画面太少，只有发射画面是直播的） 但愿这个问题不会成为一宗悬案！一个不解之谜！
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2005年10月12日 09:00 [酒泉•武卫政]:点火！2005年10月12日 09:14 船箭在200公里高度成功分离火箭工作完成。2005年10月12日 09:13 船箭分离。2005年10月12日 09:21 北京航天飞控中心宣布：飞船正常入轨。飞船变轨从１５时５４分４５秒开始，变轨发动机工作了６３秒。应该是09:13 船箭分离。时就入轨了.１５时５４分４５秒开始变轨.６３秒后变轨完成.可以参看: