格式化硬盘时，总是有这两种选择，不知选哪一种？
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NTFS和FAT32各有长短。 NTFS是一个安全文件系统，在Win2k下通常比FAT32快。不过，和NTFS不同，FAT32可以兼容Win9x。 如果你只是准备在电脑上运行Win2000的话，我建议你使用NTFS，但如果你的系统是加上Win9x或Linux的双系统，那么你必须在你的至少一个分区上使用FAT32。 并且如果你是一个真正的速度至上者，我建议你把Win2k安装在FAT32分区上，而把你的数据文件放在NTFS分区上。
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FAT32管理的文件大小不超过4G，而NTFS则更适合管理大文件。比如当你下载或采集一个大于4G的视频文件或大的文件时，NTFS系统可以保证文件的完整性，而FAT32文件系统每到接近4G的时候就会停止，这样得到的文件就不是完整的。且NTFS不把持双系统。
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总的来说NTFS比FAT32更好，效率更高也更安全但是NTFS无法支持WIN9X以及普通DOS系统，所以如果你准备用DOS操作可能比较困难。所以可以考虑WIN2K/XP的系统分区设为NTFS，同时保留一个分区为FAT32，里面可以保存GHOST镜像文件等，便于以后恢复